加L型信号放大器单个Z与靶RNA结合区域的序列长度为18~25bp，上端与L型信号放大器结合区域序列长度为14bp，那么Double Z与靶RNA结合区域长度为50bp左右，与L型信号放大器结合区域长度为28bp。对于一条特异性区域有1Kb的RNA，只需设计20对Double Z探针，而实验中20对探针只需3对结合即可检测到信号。

对于20对全部结合和只有3对结合的区别，只与信号点的大小及强度有关，而不涉及数据统计中RNA的表达量问题：

众所周知RNA在空气中易被RNA酶降解，组织或细胞中RNA易被蛋白包被，一条完整游离的RNA在组织或细胞中较难生存，这个就是传统RNA的痛点了：传统线型探针较长时，特异性较好，但灵敏度不够好；而传统线型探针较短时，灵敏度非常好，但是特异性不够，这个也是microRNA做原位杂交的头疼点。RNAscope的Double Z探针将1Kb长度探针分散化，且20对中识别3对即可，在特异性与灵敏度之间做到了兼顾，这便成就了RNAscope探针设计的核心。

RNAscope，重复率高，特异性好，灵敏度高，实验步骤简洁周期短。